科技资源开放共享平台
智能物联网设备
SSR分析系统
试剂耗材统一采购平台
软件著作权登记证书
大型仪器共享平台、LIMS及各类应用分析信息系统的开发与建设、智能物联网硬件设备研发、重要业务系统运维支持、各类数据分析、实验室管理等功能模块及系统定制开发。
联系人:段老师
电 话:15843162650
试剂耗材统一采购平台
为整合作科所科研与技术人员需求、优化供应链并提供全流程服务,生物信息及网络平台自主开发了试剂耗材统一采购平台,该平台以“统一规范有序、集中网上采购”的试剂耗材管理模式为运营核心,由重大平台中心具体负责系统开发及日常维护管理工作,实现了全所范围内试剂耗材的共享管理。平台自2016年正式运行以来,已累计完成308家供应商协议签署工作,累计注册用户账号2659个,完成18万笔到货订单的网上采购工作,实现累计销售额3.16亿元。
基因编辑脱靶位点检测
在WGS流程的基础上,生物信息及网络平台研究并尝试进行了基因编辑脱靶检测分析,利用自行编写的脚本将已分析得到的SNP、inDel位点与基因组中脱靶预测位点相比对,以确定相关脱靶位点,现已完成了水稻样本的脱靶检测分析。
T-DNA插入位点分析
生物信息及网络平台利用T-LOC生物信息分析软件构建了一套完整的基于二代测序的T-DNA插入位点分析流程,现已应用在大豆和水稻样本中,通过比对reads与T-DNA、参考基因组序列,可有效检测T-DNA在基因组中的插入位置,并获取T-DNA插入位点模式图、T-DNA和植物基因组嵌合测序read序列等分子特征信息。
WGS与RNA-Seq通用分析流程
生物信息及网络平台利用包括fastp、hisat2、gatk等成熟生物信息分析软件,分别构建了WGS和RNA-Seq的通用分析流程,现已完成了小麦样本RNA-Seq及水稻WGS的数据分析。
科研仪器共享平台及智能物联网设备
生物信息及网络平台自主研发的科研仪器共享平台(信息系统)及配套的物联网硬件,实现了全所大型科研仪器设备的统一集约化管理,为科研与技术人员提供了预约申请、仪器监控、数据采集和统计等功能,并实现与国家网络管理平台的数据对接,该系统已在中国农科院系统内广泛推广,相关工作“作物科学研究所科研仪器共享平台推动科技资源开放共享”入选2022年度中国农业科学院科研信息化典型案例,并被编入《中国农业科学院科研信息化发展报告2022》(白皮书)。
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