SSR在线分析系统

生物信息及网络平台自主研发的SSR在线分析系统，可以直接导入3730xl下机的电泳数据，能够准确识别内标峰及样品峰位置并计算bp数，同时具备预制引物组、快速峰型浏览等多种与SSR实验相配套的工具与功能，大幅提高了平台及最终用户的数据分析处理能力，现该系统已经在大豆指纹图研究中发挥了重要作用，核心算法已经申请发明专利。

基因编辑脱靶位点检测

在WGS流程的基础上，生物信息及网络平台研究并尝试进行了基因编辑脱靶检测分析，利用自行编写的脚本将已分析得到的SNP、inDel位点与基因组中脱靶预测位点相比对，以确定相关脱靶位点，现已完成了水稻样本的脱靶检测分析。

WGS与RNA-Seq通用分析流程

生物信息及网络平台利用包括fastp、hisat2、gatk等成熟生物信息分析软件，分别构建了WGS和RNA-Seq的通用分析流程，现已完成了小麦样本RNA-Seq及水稻WGS的数据分析。

科研仪器共享平台及智能物联网设备

生物信息及网络平台自主研发的科研仪器共享平台（信息系统）及配套的物联网硬件，实现了全所大型科研仪器设备的统一集约化管理，为科研与技术人员提供了预约申请、仪器监控、数据采集和统计等功能，并实现与国家网络管理平台的数据对接，该系统已在中国农科院系统内广泛推广，相关工作“作物科学研究所科研仪器共享平台推动科技资源开放共享”入选2022年度中国农业科学院科研信息化典型案例，并被编入《中国农业科学院科研信息化发展报告2022》（白皮书）。