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大型仪器共享平台、LIMS及各类应用分析信息系统的开发与建设、智能物联网硬件设备研发、重要业务系统运维支持、各类数据分析、实验室管理等功能模块及系统定制开发。

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应用案例

SSR在线分析系统

生物信息及网络平台自主研发的SSR在线分析系统,可以直接导入3730xl下机的电泳数据,能够准确识别内标峰及样品峰位置并计算bp数,同时具备预制引物组、快速峰型浏览等多种与SSR实验相配套的工具与功能,大幅提高了平台及最终用户的数据分析处理能力,现该系统已经在大豆指纹图研究中发挥了重要作用,核心算法已经申请发明专利。


基因编辑脱靶位点检测

在WGS流程的基础上,生物信息及网络平台研究并尝试进行了基因编辑脱靶检测分析,利用自行编写的脚本将已分析得到的SNP、inDel位点与基因组中脱靶预测位点相比对,以确定相关脱靶位点,现已完成了水稻样本的脱靶检测分析。


WGS与RNA-Seq通用分析流程

生物信息及网络平台利用包括fastp、hisat2、gatk等成熟生物信息分析软件,分别构建了WGS和RNA-Seq的通用分析流程,现已完成了小麦样本RNA-Seq及水稻WGS的数据分析。


科研仪器共享平台及智能物联网设备

生物信息及网络平台自主研发的科研仪器共享平台(信息系统)及配套的物联网硬件,实现了全所大型科研仪器设备的统一集约化管理,为科研与技术人员提供了预约申请、仪器监控、数据采集和统计等功能,并实现与国家网络管理平台的数据对接,该系统已在中国农科院系统内广泛推广,相关工作“作物科学研究所科研仪器共享平台推动科技资源开放共享”入选2022年度中国农业科学院科研信息化典型案例,并被编入《中国农业科学院科研信息化发展报告2022》(白皮书)。

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